地球公元2032年（危机纪元25年），三体第二舰队正式启航。
尽管第二舰队只比第一舰队晚了50地球年，但技术水平却提高了不少。
相比于第一舰队强电磁加固材料为主体，三体第二舰队则完全由强相互作用力材料打造，对于第一舰队来讲，强相互作用力材料是十分珍贵的，但对于第二舰队来讲则完全相反，强相互作用力材料只是随时可以制造的消耗品。
在上一代三体元首的要求下，第二舰队相比于第一舰队加装了完整状态的生态系统，这种大胆的行为，直接让第二舰队拥有了脱离三体文明独走的能力。
虽然同样是通过正反物质湮灭来进行驱动，但相比于第一舰队只能在宇宙中获取正反粒子来进行低烈度湮灭不同，第二舰队可以利用星际物质来自主制造正反物质，这使得第二舰队平均航速达到了第一舰队120%。
当然，进行10%光速的长期全功率加速仍然是不可能的，反物质粒子制造或捕捉的速度完全赶不上舰队加速消耗的速度，反物质虽然好，但是制造和捕捉是一个大问题。
最重要的是，相比于第一舰队，第二舰队在设计之初就预留了光速驱动引擎的位置，且第二舰队自身具备完善的科学研究系统。在第二舰队中脱水储存的40万具三体精英，更是让第二舰队随时可以在其他星系开花结果。
尽管第二舰队仍然通过智子与三体星系保持沟通，且仍在向太阳系行进，但已经实质上成为了完全独立的存在。
而这一切都要归功于上一代高瞻远瞩的三体元首，当然，这位三体元首在几十年前的三体大低谷的动乱中，已经践行的承诺，被作为新时代的引火物燃烧殆尽了。
