药王秘传的分支「内秘派」丹士所著的经文，作者佚名。
现存此书均为誊录本，其前言记载了本书重现的过程：罗浮丹鼎司「观颐台」在星历6610年前后清点史料典籍，并意外从书库中发现了本书。当时丹鼎司就此书是否应当被销毁发生了激烈争论，最终司鼎白泽大人选择了折衷方案：销毁原件，但将该书内容誊录、封存。只有司鼎、医士长、丹士长、医助长及以上等级的官员可将其作为史料查询。
药王秘传内秘派信徒深信一个观点：仙舟人自获得「建木」恩赐转化为长生种后，体内拥有形肖「建木」枝叶形态的经脉回路。这些经脉通向名为「丹腑」的器官：它是仙舟人获得第二次进化（或曰「飞升」）的关键。
《黄气阳精经》在《药师五脏经》的理论基础上系统阐述了仙舟人的经脉结构，并提出了以身躯为土壤，以吐纳为风雨，培育丹腑（种子），令经脉（枝叶）舒展，最终在体内成就「内在的建木」，令其茁壮蕃生，此之所谓内秘。而书名所提到的「黄气」，则是内秘派理论中推动生命活动的精微之力——与代表死亡、衰败倾向的「玄气」相对。作者相信，生命的意义便在于维持黄气的存续，令生命进化。
