根据监测到的信息，碇真嗣在经历初次作战后，被安排转入第三新东京市的一所市立中学，似乎试图让他回归某种「正常」的校园生活。
陈瑜（第二分身）随之将观测点转移至学校周边。
这所学校从表面上看与任何普通中学无异，学生们进行着常规的课程与活动。
但陈瑜敏锐地察觉到，校园内外部署着不少便装特工，他们伪装成校工、家长或路人，持续而隐蔽地监视着碇真嗣的一举一动。
整个环境呈现出一种外松内紧的安保态势。
陈瑜（第二分身）没有急于与碇真嗣进行物理接触。
他保持着安全距离，利用动力甲搭载的超远距离、高精度传感器，持续收集着这名少年驾驶员在非战斗状态下的行为模式、生理指标（通过非侵入式生命体征扫描）以及极其微弱的情绪波动数据。
这些日常信息，对于理解驾驶员的身心状态与EVA同步率之间的关联，是战斗数据的重要补充。
正是在这种持续观测中，他注意到了另一名特殊的存在——绫波丽。
这名拥有蓝色短发和红色眼眸的少女，同样身着校服，但其行为模式、表情变化乃至生命体征的基线都与常人存在微妙差异，并且她与碇真嗣之间似乎存在着某种非主动性的、淡漠的互动。
两名驾驶员的同时存在，提供了更丰富的对比研究样本。
为了获取更基础的生物学数据，陈瑜（第二分身）决定尝试采集两人的DNA样本。这并非难事，利用些许灵能，技巧和一些精密设备，他成功地从两人途径的场所，获取了包括脱落头发、不易察觉的皮肤碎屑在内的微量生物组织。
他对这些样本进行了快速的基因测序与对比分析。
