他也是卧薪尝胆，投入了巨量的金钱和心力，才使得广东水师焕然一新。现在的二百条船，只是广东水师的一半船只，整个广东水师如今有四百多条船；广西梧州、廉州也有几个水军卫所，几十条船，同样归袁崇焕节制。
广东水师的发展路线与登莱水师类似，也走的是海军陆战队的路子，这是因为他们都脱胎于大明的沿海卫所，都是为了海防而设置的，相较于水上能力，其岸防的任务更重要些。袁崇焕抽调卫所精锐，按照营兵制整编，如今广东水师有战兵两万余。
朱由检对于袁崇焕的所作所为倒也不是完全不了解，毕竟两广的地方官没少弹劾这厮专擅、图谋不轨、与民争利等。朱由检见其中花样百出，但没有欺男霸女、贪污腐败也就不管了，国家那幺大哪能既要又要呢，适当放权也是必要的。
袁崇焕不知葡萄牙人心中所想，什幺马尼拉屠华，他听都没听说过，况且大明有制，百姓擅自离开户籍地是犯法的，探亲访友做生意行船都需要对应的路引、船引，海外移民被视为逃民，是不被认为是本国百姓的，他来找茬另有借口。
袁崇焕看向濠境内那两座高耸的教堂，幽幽道：「陛下早有旨意，让各地方衙门没收寺产，遣散僧侣，你们这里教堂林立，我作为两广总督不能视而不见，你们这样让我很难办啊！」
「不是冲我们来的？！」澳门总督与议事会的几位核心成员面面相觑。他们虽然不是宗教人员，却是虔诚的天主教徒，澳门是有主教的，教皇在澳门设置了主教区，整个远东包括东南亚、日本在内的国家传教活动都由澳门主教区管辖；
他们不可能眼看着大明将教堂拆掉，使他们脱离上帝的怀抱，变成迷途的羔羊，在海上讨生活总得信点什幺，总不能改信妈祖吧？！
「据我所知，总督大人你的夫人似乎也是我主虔诚的信徒吧？！」市议员公沙试探地问道。
袁崇焕咧嘴一笑：「信仰上帝就必须要有教堂幺，我觉得直接阅读圣经，向上帝祈祷也是可以的嘛。」
「您是说誓反教？！偶不，总督阁下，您不能支持这群异端！」罗郎也惊呼道，「快去请华伦他主教过来！」
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