王献臣弹劾奏疏中事情的真相是：
泰宁三卫的人至宁远，向宁远守备张天祥索要泰宁三卫生活所必须的食言、茶叶等物，张天祥从他们口中得知，建州进贡的使团就在附近。
为了邀功，张天祥令人射伤建州使团的人，污蔑是泰宁三卫的人干的。随后，张天祥做出追击泰宁三卫的贼人的架势，在“追击”途中，屠杀了一个村子，并将村民枭首，将其首级冒作泰宁三卫贼人首级。
以大捷的名义向朝廷报功。
张天祥不仅杀良冒功，欺骗朝廷，蒙蔽皇上。
王献臣的弹劾奏疏一出，明孝宗异常关注，令锦衣卫核查真相，锦衣卫赴宁远，很快查出了真相，张天祥确实杀良冒功，欺骗朝廷，蒙蔽皇上。
于是，张天祥被逮捕入狱问罪，死于狱中。
事情至此，按理来说应该告一段落了，可是明朝还有一个机构，东厂。
东厂秘密调查了，调查后，发现王献臣之所以得知张天祥杀良冒功等事情，是因为宁远一名叫张茂的军官和他儿子张钦向王献臣揭发检举的。
这个张茂跟张天祥还有关系，他是张天祥爷爷的小舅子，也就是张天祥的舅爷爷，因为家族利益，他和张天祥之间有矛盾，所以他告发张天祥。
身为御史的王献臣并没有查清楚张茂跟张天祥的关系和矛盾，就用了张茂的供词和他提供的证据。
东厂又调查发现王献臣在宁远查案时曾登当地的某山，有游山玩水之嫌疑。
