中部都司从哈拉和林向东，到科尔沁城为止，包括了大幹耳朵、八卦城、喀喇沁、土默特城，治所归化城，下辖陆军第7/8卫。
由土默特侯、正五品武德将军鄂木布统领，杨涟长子、原东北都司都指挥使、正五品武德将军杨之易任都指挥参谋。
中西部都司西起塔城、德鲁日巴，东到哈拉和林，南至别失八里、巴里坤一线，治所委鲁母，下辖陆军第9/10/11/12卫和骑兵第2卫。都指挥使原内蒙古都司正四品明威将军白不平，都指挥参谋正六品昭信校尉汉宝包。
从兵力部署上就能看出来，帝国的陆地威胁主要在西边。中西部都司5个卫、西域都司5个卫、青海都司兼管甘肃3个卫、四川都司3个卫、西南都司5个卫，整整21个卫12万大军，帝国陆军的多一半全集中在西部。
其余都司的辖区、编制基本不变，北方都司改名直隶都司，统领4个卫陆军和1个卫骑兵，辖区直隶、山西、陕西三省。
西南都司统领西南三省和安南特区，下辖5个卫。吕宋岛则交给了海军陆战都司驻扎，既方便补给和指挥也更有针对性。
除了军队重新部署，行政区域划分也得相应的跟上。为此朝廷又把原有的内蒙古特区和辽阳省撤销，增加了西伯利亚、中西部、中部和中东部四个特区。
至此为止，大明帝国共有直隶、山东、河南、山西、陕西、四川、贵州、云南、广西、广东、福建、浙江、江苏（原南直隶）、江西、湖广15个省，吕宋、安南、中东部、中部、中西部、西伯利亚6个特区。
