在清军的偷袭之下，朝鲜精锐伤亡惨重，几乎全军覆没。
惨败后，城内士气彻底崩溃，君臣上下更是面如死灰。
而此时，清军主力也陆续赶到，朝鲜军队无力出城再战，只好据守山城不出。
皇太极并不急于攻城，而是传令后方：
“速携红衣大将军炮及一切火器前来，为攻城做好万全准备。”
时至年底，皇太极在南汉山城西侧设立御营。
他命令麾下清军攻占汉城，搜捕躲藏的朝鲜军民，掠取财物牲畜，供给大军欢度新年。
崇祯十年正月初四，后方三顺王的火炮部队，终于抵达了城下。
得到火炮后，皇太极依旧不急于攻城，反而将御营移至汉江北岸，继续对山城实施严密封锁。
他采取围点打援的策略，持续消灭朝鲜有生力量。
从十二月到正月，几路主要的朝鲜勤王军相继被歼灭，南汉山城彻底成为一座孤岛。
正月十七日，皇太极向困守孤城的李倧发出了最后通牒：
“欲生耶，亟宜出城归命；欲战耶，亦宜亟出一战。”
李倧见各路勤王军相继被灭，而自己的亲爹大明，也没有来救的意思。
再加上内无粮草，突围无望，终于放弃了抵抗的念头。
他派出使臣，表示愿意投降，对清称臣，并试探性地提出了一些保留体面的条件。
但此时，战场的主动权完全掌握在皇太极手中，战场上得不到的东西，谈判桌上更不可能得到。
为了彻底粉碎李倧的侥幸心理，正月二十二日，清军在多尔衮的指挥下，对江华岛发动了渡海战役。
朝鲜的庙社神主、世子嫔、两大君、元孙等王室人员，以及大臣家眷都藏身于此岛。
江华海峡历来被朝鲜君臣视为天堑，时值严冬，海水冰冷刺骨，海面上还漂浮着冰块，渡海难度极大。
然而，多尔衮指挥清军，利用红衣大炮的掩护，强攻江华岛北面的甲串津渡口。
朝鲜水军本欲出击拦截，不料海水突然退潮，朝鲜水军被困在了距离甲串津数百步外的海域无法动弹。
多尔衮趁机率军猛攻，迅速拿下甲串津，成功登陆了江华岛。
岛上的守军全军覆没，藏身在此的朝鲜王室成员、宗室、以及众多大臣的家眷，全成了清军的俘虏。
后方沦陷，家眷尽数落于敌手，南汉山城中君臣战心尽失。
正月二十三日夜，清军将红衣大炮等推至前沿阵地，对南汉山城进行了猛烈炮击。
史载：
“炮丸大如鹅卵，或有如小儿头者，能飞越冈峦，乱触宫墙。”
“声震天地，昼夜不绝，城中之人比比中死，堞所触皆崩溃，人心因此大汹。”
在火炮的威胁下，李倧再也顾不得任何条件，连夜派出大臣，向皇太极呈上了降书，只求保全姓名。
皇太极接到降书后，宣布赦免李倧“不尊王化”之罪，同时又提出了十一项条件：
一、朝鲜必须立即缴纳明朝颁赐的所有诰命、册印，彻底断绝与明朝的宗藩关系，停止使用明朝年号，尊奉大清为正朔。
二、朝鲜国王需将世子及另一名王子送往大清为质，朝鲜各大臣亦需派遣子弟入质。
三、朝鲜有义务协助清军攻打明朝，当前的首要任务，便是配合清军攻取皮岛。
四、每逢大清皇帝寿辰、元旦、冬至及皇后、皇太子诞辰，朝鲜须依照昔日朝贺明朝的礼仪规格，遣使奉表朝贺。
五、凡被清军俘获后渡过鸭绿江的朝鲜人，若逃回朝鲜，必须遣返给清朝，不得收留，但允许其家属出资赎回。
六、朝鲜王室需与清朝宗室贵族联姻，以固“盟好”。
七、朝鲜不得再修缮任何新旧城池、城墙及堡垒。
八、朝鲜需将境内所有瓦尔喀人送还大清。
九、允许朝鲜继续与日本进行贸易，但朝鲜有义务协助大清与日本建立联系。
十、禁止朝鲜与图们江外的瓦尔喀人进行贸易，若发现此类人员，须逮捕并移交清朝。
十一、朝鲜每年需向大清缴纳巨额岁贡，具体品种数量再行商议。
